Rečni sistemi Mure in Drave so zaradi človekovih posegov in spremenjenih hidromorfoloških razmer izgubili del svoje naravne dinamike.
Spremenjene poplavne ravnice, zmanjšano nastajanje prodišč, stranskih rokavov in mrtvic ter njihovo postopno izsuševanje in zaraščanje zmanjšujejo kakovost habitatov. Dodatne pritiske predstavljajo intenzifikacija ali opuščanje kmetijske rabe, preteklo intenzivno gospodarjenje z gozdovi, bolezni drevja, naravne ujme ter invazivne tujerodne vrste. Posledično so številne vrste in njihovi življenjski prostori resno ogroženi.